A atividade antimicrobiana do glutaraldeído pode ser alterada com a diluição e a presença de matéria orgânica. Soluções neutras ou alcalinas de glutaraldeído possuem ação microbicida e anti-corrosiva superiores às soluções ácidas. O glutaraldeído não é corrosivo para metais e não danifica artigos com lentes, borracha ou plástico. É necessário ventilação do local de uso (o limite de glutaraldeído no ar é de 0,2 ppm), imersão em recipientes plásticos hermeticamente fechados, uso de equipamentos de proteção individual (luvas, máscara, óculos) (APECIH, 2003). Cada fabricante de glutaraldeído deve determinar a concentração mínima que seja eficaz (MEC) para a solução comercializada. Em São Paulo desde março de 2007 está em vigor a Resolução SS-27, de 28 de fevereiro de 2007, que aprova a Norma Técnica que estabelece medidas de controle no uso de glutaraldeído nas instituições de Assistência à Saúde.
